CTとMRIの違いを料金や仕組みから徹底比較！どちらが高い？費用目安も解説

2026年4月2日

「お医者さんから『詳しい検査のために、CTかMRIを撮りましょう』と言われたけれど、一体何が違うの？」「検査の料金はいくらくらいかかるんだろう？」

突然の検査の提案に、こんな不安や疑問を感じていませんか？見た目が似ている大きな機械に入ることは分かっていても、その中身や費用のことまで詳しく知る機会はなかなかないですよね。

でも、ご安心ください。この記事を読めば、CTとMRIの根本的な違いから、気になる料金のこと、検査を受ける上での注意点まで、あなたの知りたい情報がきっと見つかります。

それぞれの検査の得意なこと・苦手なことを理解すれば、なぜお医者さんがその検査を選んだのかが分かり、より安心して検査に臨めるはずです。さあ、一緒にCTとMRIの世界をのぞいてみましょう。

CTとMRIの基本的な違いを5つのポイントで比較

CTとMRIは、どちらも体の内部を詳しく見るための大切な検査ですが、その仕組みや特徴は大きく異なります。まずは、この2つの検査の決定的な違いを5つのポイントに絞って、分かりやすく比べてみましょう。

1. 検査の「原理」が全く違います

見た目は似ていますが、CTとMRIでは画像を撮影するための原理が根本的に異なります。

CT (Computed Tomography：コンピュータ断層撮影)
CTは、一言でいうと「レントゲン検査の親戚」のようなものです。 X線（放射線）を体の周りから360度照射し、体を通り抜けてきたX線の量の差をコンピューターで処理することで、体の断面図（輪切りの画像）を作り出します。
MRI (Magnetic Resonance Imaging：磁気共鳴画像)
一方、MRIは放射線を一切使いません。その代わりに、非常に強力な磁石と電波（FMラジオに使われるような電波）を使って画像を得ます。強い磁力で体内の水素原子を整列させ、そこに電波を当てることで発生する信号を捉え、コンピューターで画像化する仕組みです。人の体の約7割が水分（水素原子を多く含む）であるため、この原理を利用して鮮明な画像を得ることができます。

2. 「得意なこと」と「苦手なこと」

原理が違うため、当然ながらそれぞれに得意な分野と苦手な分野があります。どちらの検査が優れているというわけではなく、調べたい目的によって使い分けられます。

	CT検査	MRI検査
得意なこと	骨の描出: 骨折や骨の異常を非常に鮮明に写し出します。肺の検査: 肺炎や肺がんなど、空気の多い臓器の観察に適しています。急性期の出血: 特に脳出血やクモ膜下出血など、突然の出血を素早く見つけるのが得意です。広範囲の撮影: 胸からお腹、骨盤までといった広い範囲を短時間で撮影できます。	軟部組織の描出: 脳、脊髄、筋肉、靭帯、半月板、椎間板など、水分を多く含む柔らかい組織の観察が非常に得意です。脳梗塞の早期発見: 発症して間もない脳梗塞をCTよりも早く見つけることができます。血管の撮影: 造影剤を使わなくても、脳動脈瘤など血管の状態を詳しく調べられます（MRA）。婦人科・泌尿器科領域: 子宮や卵巣、前立腺といった骨盤内の臓器の診断に優れています。
苦手なこと	軟部組織の微妙な違いを区別するのはMRIほど得意ではありません。骨に囲まれた部分では画像の乱れ（アーチファクト）が出ることがあります。	骨の細かい情報や、空気の多い肺の観察はCTに劣ります。急性期の出血はCTの方が見つけやすい場合があります。石灰化病変の評価がしづらいことがあります。

このように、例えば頭を強く打った場合はまずCTで出血や骨折の有無を確認し、手足のしびれや麻痺がある場合はMRIで脳梗塞や脊髄の異常を詳しく調べるといった使い分けがされています。

3. 「検査時間」と「音」

検査を受ける際の快適さにも違いがあります。

CT検査
撮影時間が非常に短いのが大きなメリットです。検査部位にもよりますが、撮影自体は数分、準備を含めても10分～15分程度で終わることがほとんどです。検査中の音も比較的静かです。
MRI検査
CTに比べて検査時間が長く、20分～1時間ほどかかります。これは、様々な種類の画像を撮るために何度も撮影を繰り返す必要があるためです。また、検査中は「ガンガン」「コンコン」といった工事現場のような非常に大きな音が連続して鳴り響きます。

4. 「放射線被ばく」の有無

体への影響として気になるのが放射線被ばくです。

CT検査
原理上、X線を使用するため放射線被ばくがあります。ただし、検査で使われる放射線の量は、健康に影響が出るとされるレベルよりもはるかに低く、診断によって得られるメリット（利益）が被ばくによるデメリット（不利益）を上回る場合にのみ行われます。近年の装置は性能が向上し、被ばく量を低減する技術も進んでいます。
MRI検査
強力な磁石と電波を使用するため、放射線被ばくは一切ありません。そのため、繰り返し検査を行う場合や、お子さん、若い方の検査にも安心して用いられます。

5. 検査を受けられないケース

どちらの検査も、体の状態によっては受けることができない場合があります。

CT検査
- 妊娠中、または妊娠の可能性がある方（絶対に受けられないわけではありませんが、慎重な判断が必要です）。
- 造影剤を使用する場合、アレルギーのある方や腎機能が著しく低下している方。
MRI検査
- 心臓ペースメーカーや植込み型除細動器（ICD）などを装着している方（MRIの磁力で誤作動や故障を起こす危険があるため、原則として検査できません）。 ※近年はMRI対応の機器も出ています。
- 人工内耳や一部の脳動脈瘤クリップなど、体内に金属が埋め込まれている方。
- 閉所恐怖症が強く、狭いトンネル状の装置の中でじっとしているのが難しい方。
- 刺青やアートメイクがある場合（インクに含まれる金属成分が熱を持つことで、やけどのリスクがあります）。

これらの条件に当てはまる場合は、必ず事前に医師や検査技師に伝えることが重要です。

気になる「料金」の違いと保険適用の話

検査内容と並んで、多くの方が気になるのが「料金」ではないでしょうか。CTとMRIでは、料金にも違いがあります。ここでは、なぜ料金が違うのか、そして保険が適用された場合の自己負担額の目安について詳しく見ていきましょう。

1. なぜMRIの方が高い傾向にあるの？

一般的に、MRI検査はCT検査よりも費用が高くなる傾向があります。その理由はいくつか考えられます。

装置の価格と維持費：MRI装置はCT装置に比べて本体価格が非常に高価です。また、強力な磁場を維持するために液体ヘリウムで超電導磁石を常に冷却する必要があるなど、設置やメンテナンスにかかるコストも高くなります。
検査時間の長さ：前述の通り、MRIはCTよりも検査に時間がかかります。一つの装置を長時間占有することになり、その分、人件費などの運用コストも高くなるため、料金に反映されます。

これらの要因から、MRI検査の方がCT検査よりも診療報酬点数（医療費の計算の元になる点数）が高く設定されています。

2. 保険適用（3割負担）での料金目安

病気の診断のために医師が必要と判断した検査は、健康保険が適用されます。その場合、自己負担額はかかった医療費の1割～3割となります。以下に、3割負担の場合の一般的な料金の目安をまとめました。

※ご注意：これはあくまで検査そのものにかかる費用の目安です。実際には、この他に初診料や再診料、画像診断管理加算、薬剤料などが加わります。また、医療機関や使用する装置の性能によっても金額は変動します。

検査の種類	3割負担の料金目安	特徴
CT（単純）	約5,000円～ 8,000円	造影剤を使わずに撮影する基本的なCT検査です。
CT（造影）	約8,000円～ 13,000円	血管や病変をより詳しく見るために、造影剤を注射しながら撮影します。
MRI（単純）	約7,000円～ 10,000円	造影剤を使わずに撮影する基本的なMRI検査です。
MRI（造影）	約10,000円～ 20,000円	腫瘍の性質などをより詳しく調べるために、造影剤を注射しながら撮影します。

このように、CTとMRIを比較するとMRIの方が高く、また造影剤を使用するとさらに費用が加算されることが分かります。

3. 自由診療（人間ドックなど）の場合

特に症状はないけれど、予防や健康チェックのために検査を受けたいという場合は「自由診療」となり、保険は適用されません。費用は全額自己負担となります。

代表的なものに「脳ドック」があります。脳ドックは、主にMRI/MRA検査を用いて、自覚症状のない脳梗塞や脳動脈瘤、脳腫瘍などを早期発見することを目的としています。費用は医療機関によって様々ですが、数万円から十数万円程度が相場となっています。

CT・MRI検査でよくある質問Q&A

ここでは、患者さんからよく寄せられるCT・MRI検査に関する疑問にお答えします。

Q1. 閉所恐怖症なのですが、MRI検査は受けられますか？
A1. MRI検査は狭いトンネル状の装置の中で長時間過ごすため、閉所恐怖症の方にはつらい場合があります。事前に医師に相談すれば、気分の落ち着く薬を使ったり、比較的トンネルの開口部が広い「オープン型MRI」という装置がある医療機関を紹介してもらえたりすることがあります。まずは正直に不安な気持ちを伝えることが大切です。

Q2. 体に金属（インプラントやタトゥー）があっても大丈夫？
A2. MRI検査では強力な磁石を使うため、金属の種類によっては非常に危険です。心臓ペースメーカーや古いタイプの脳動脈瘤クリップは原則禁忌です。また、歯科インプラントや整形外科で用いたボルトなどは、材質によっては検査可能な場合もありますが、画像の乱れの原因になることがあります。タトゥーやアートメイクは、インクに含まれる金属成分が熱を持ってやけどをする恐れがあるため、事前の申告が必須です。 CT検査は、金属が画像に影響（アーチファクト）を与えることはありますが、MRIほど強い制限はありません。

Q3. 「造影剤」って何ですか？副作用はありますか？
A3. 造影剤とは、特定の臓器や血管、病変などをよりはっきりと画像に写し出すために使われるお薬です。腕の静脈から注射して検査を行います。CTでは「ヨード造影剤」、MRIでは主に「ガドリニウム造影剤」が使われます。CTの造影剤では体が熱く感じることがありますが、すぐに治まります。ごくまれに、吐き気やかゆみ、じんましんなどの副作用が出ることがあります。以前に造影剤で気分が悪くなったことがある方や、喘息、アレルギー体質、腎機能に問題がある方は、必ず事前に申し出てください。

Q4. 検査当日の食事や服装で気をつけることは？
A4. 腹部の検査など、検査部位によっては食事制限が必要になる場合があります。事前に医療機関からの指示をよく確認してください。服装については、検査室で専用の検査着に着替えるのが一般的です。金属のついた下着（ワイヤー入りブラジャーなど）やアクセサリー、湿布、カイロなどは外していただきます。また、MRI検査ではカラーコンタクトレンズや、金属を含むことがある化粧品（アイシャドウなど）も外すよう指示されることがあります。